Pefkos est situé au-dessus d'un plateau calcaire submergé qui descend de trois à trente mètres en moins de deux cents mètres au large, créant un terrain d'entraînement naturel qui ancre l'industrie de la plongée du village depuis le début des années 1990. La profondeur graduée du plateau permet aux instructeurs de mener des certifications en eau libre sans transferts en bateau, tandis que les plongeurs avancés suivent le tombant vers le sud en direction de la baie de Lardos, où les herbiers de posidonies laissent place à des champs de rochers colonisés par des poulpes et des murènes. La température de l'eau se maintient au-dessus de vingt-deux degrés Celsius de mai à octobre, et la visibilité moyenne est de quinze à vingt-cinq mètres en dehors du pic d'août, où la prolifération de phytoplancton réduit la clarté. Le système récifal de Pefkos s'étend sur quatre kilomètres carrés de fonds marins cartographiés par le Centre hellénique de recherche marine en 2019. Des affleurements rocheux situés entre douze et dix-huit mètres abritent des mérous, des daurades et des barracudas saisonniers, tandis que les zones moins profondes contiennent des fragments d'amphores issus des routes commerciales de l'époque romaine documentées au Musée maritime de Rhodes. Les opérateurs de plongée travaillent au sein d'un système de zonage volontaire établi en 2021 pour faire pivoter l'utilisation des sites et protéger les nurseries de poissons juvéniles près du rivage. Cet arrangement reflète les changements plus larges du tourisme de plongée grec, qui est passé de la location d'équipement à des programmes structurés après l'harmonisation européenne des normes des instructeurs en 2015. Les programmes de plongée sous-marine à Pefkos, Rhodes suivent désormais les parcours de certification PADI, SSI et CMAS, les cours pour débutants s'étendant généralement sur deux jours de sessions en piscine et de plongées en milieu protégé avant de passer aux sites en eau libre. Les expériences Discover Scuba compressent l'introduction en une seule matinée, associant des compétences en eau peu profonde à une visite guidée du récif limitée à six mètres. Les forfaits de plusieurs jours incluent souvent des cours de photographie sous-marine, utilisant les espèces résidentes du récif de Pefkos — serran écriture, castagnole et girelle paon — comme sujets pour la macrophotographie. La géographie compacte du village place les centres de plongée à moins de cinq minutes à pied des hébergements, éliminant les frictions logistiques courantes dans les grands complexes. La surveillance environnementale actuelle montre que le récif maintient une biodiversité stable malgré l'augmentation du trafic de plongeurs, les études annuelles n'enregistrant aucun stress corallien significatif ni invasion d'espèces exotiques. L'eau pauvre en nutriments de la mer Égée limite la croissance des algues, préservant la clarté qui rend le sud-est de Rhodes viable pour la plongée toute l'année. Les opérateurs intègrent désormais des briefings sur la conservation marine dans les sessions de pré-plongée, abordant le contrôle de la flottabilité et les protocoles de contact introduits dans le cadre des amendements Blue Flag 2023 de la Grèce pour les sites de plongée.